馬里奧制造中提供了初代、馬里奧三代、馬里奧世界和新超馬四種版本的編輯器，不同版本之間存在一些明顯差異。
超級馬里奧初代
初代是元素最簡樸的一個版本，很多后面馬里奧作品的元素都沒有，比方說不能手持龜殼、彈簧等道具。初代也沒有小瑪麗奧下蹲的動作可以做。版本中只有火焰花這一種二階的升級道具，不過初代擁有Amiibo變裝蘑菇可以使用，或者玩家可以將普通蘑菇變成Luigi蘑菇，讓馬里奧變身瘦高身，可以跳得更高更遠。并不是說初代機制簡單就沒有后面的版本好玩，畢竟大部分馬里奧玩家的情懷在初代里。
超級馬里奧三代
馬里奧三代比起初代來說新增加的元素就很多了，我們可以在三代中拾取龜殼等道具，并且可以做出小馬里奧下蹲的動作。在馬里奧三中首次出現的羽毛道具可以讓玩家在極速狀態下飛行一段時間，并且擁有近戰攻擊能力。馬里奧三代的版本比較適合去制作飛行的關卡，配合上貍貓裝去讓玩家在地圖中飛行。同時來說，對比新超馬版本，馬里奧三代也可以算作簡化操作版的新超馬。不想體驗新超馬復雜操作的話，馬里奧三代也是很好的替代品。
超級馬里奧世界
馬里奧世界和馬里奧三代比較相似，擁有可以讓馬里奧馳騁天空的斗篷裝。不過比起其他版本的馬里奧來說，很多小怪的模式發生了一些改變，甚至說磚塊的屬性也不太一樣，需要玩家適應。耀西在這款作品中開始代替鞋子出現。玩家在馬里奧世界中可以使用旋轉跳動作，可以讓馬里奧立足一些正常跳躍無法立足的地方。扔龜殼的方式也增加了垂直投擲方式。總的來說，馬里奧世界的版本也是一個多樣化的版本，但是操作難度上要有明顯提升。
新超級馬里奧
新超馬版本是目前最受歡迎的一個版本類型。不僅畫風漂亮，同時包含很多新的動作元素。跳墻壁，旋轉滯空，三段跳等新鮮的玩法只能在新超馬中實現，讓新超馬版本的可玩性有了質的提升。喜歡制作超級復雜關卡的話或者大神級毒圖的話，新超馬版本是最合適的選擇。
